La Direzione Generale è responsabile della gestione esecutiva dell'azienda, dell'implementazione delle strategie, della coerenza degli ospedali al modello integrato EOC e dello sfruttamento ottimale delle sinergie all'interno dell'azienda. La Direzione Generale rende conto dei risultati al Consiglio di Amministrazione, il quale è chiamato a sua volta a rispondere del suo operato nei confronti del Gran Consiglio.
Nell'immagine sono raffigurati i membri della Direzione Generale dell'EOC. Da sinistra a destra:
Adriana Degiorgi Capo Area di Supporto
Monica Ghielmetti Gianazza Capo Area Risorse Umane
Carmine Navarra Capo Area Tecnica
Marco Bosetti Capo Area ICT
Glauco Martinetti Direttore Generale EOC
Doris Giulieri Capo Area Finanze e Controlling
Paolo Ferrari Capo Area Medica
Michele Ghielmini Capo Area Formazione Accademica, Ricerca e Innovazione